ПЦР – полимеразная цепная реакция. Это генетический тест. Позволяет в собранном у пациента материале обнаружить ДНК(РНК) или части ДНК(РНК) инфекционного агента или дезоксирибонуклеазу (рибонуклеазу) самого пациента.
Амплификация – копирование коротких фрагментов ДНК микроорганизма. Осуществляется несколько раз в пределах одного температурного цикла в условиях специализированной лаборатории.
Свойства метода ПЦР:
- высокая точность и чувствительность метода
- специфичность (выделяют ДНК инфекционного агента, ДНК пациента и других микроорганизмов)
- универсальность выполнения лабораторного этапа исследования
- скорость выполнения ПЦР выше, чем при использовании столь же точного культурального метода (от 5 часов до суток)
ПЦР является достаточно точным анализом, используемым при постановке диагноза при любом инфекционном заболевании.
Когда результат трактуется как ложноотрицательный?
Если в крови, моче, мокроте или мазках нет следов возбудителя, так как микроорганизмов в принципе мало, или материал забран с нарушением требований к технике манипуляции. Ложноположительных результатов при выполнении полимеразной цепной реакции не бывает.
ПЦР не зависит от пола пациента, сдававшего данный материал. Соответственно, по сути, ПЦР у женщин ничем не отличается от ПЦР у мужчин.
- Что нужно сдавать на ПЦР
- Применение ПЦР
- На какие инфекции проверяет мазок на ПЦР
- Когда назначается ПЦР
- Технология забора мазка на ПЦР
- Как берут кровь на ПЦР
- Хранение и транспортировка ПЦР анализов
- Аналитический этап ПЦР диагностики
- Интерпретация результатов ПЦР анализа
Что нужно сдавать на ПЦР
Мазки:
- из мочеиспускательного канала
- из прямой кишки
- со слизистой глаза и нижнего века
- из цервикального канала
- из влагалища
- из зева
- с поверхности кожных высыпаний и язв
Кровь, секрет предстательной железы, вода, почва, смывы с поверхностей и даже продукты.
Применение ПЦР
- диагностика заразных заболеваний, в том числе венерических
- определение генетических заболеваний
- генотипирование, создание генотипического паспорта
- анализ ГМО продуктов и качества продуктов питания
- определение личности
- установление отцовства
На какие инфекции проверяет мазок на ПЦР
ПЦР чувствительна к любым известным микроорганизмам.
То есть способна выделить ДНК любого возбудителя: бактерии, вирусы, простейшие, грибы.
Список возбудителей, которые выявляются методом ПЦР, совпадает со списком инфекционных агентов, способных вызывать ИППП.
- сифилис
- трихомониаз
- хламидиоз
- микоплазма и уреаплазма
- гонорея
- ВПЧ
- мягкий шанкр
- гарднереллез
- генитальный или иной герпес
- донованоз
- цитомегаловирусная инфекция
- ВИЧ
- вирусные гепатиты
- контагиозный моллюск
- саркома Капоши
- кандидоз
- фтириаз
- чесотка
Когда назначается ПЦР
Имеет значение срок забора материала. Анализ будет информативен уже в продромальном периоде заболевания. В разгар инфекционного процесса результат достигается практически с гарантированной точностью.
Для определения эффективности лечения ПЦР назначают не ранее чем через 30-60 дней по завершении курса антибиотиков.
Технология забора мазка на ПЦР
Для женщин необходима некоторая подготовка к забору мазка, в том числе на ПЦР.
Подготовка к забору мазков:
- в день забора материала не мыться, не спринцеваться
- не мочиться минимум за 2 часа до забора
- мазки не собирают в период менструации и в течение 2 дней после нее
- накануне не применять антисептические и антибактериальные средства, в том числе местно (свечи, орошение, таблетки, инъекции)
- антибиотики должны быть приняты курсом, но первое исследование назначают через месяц после последнего приема
Рассмотрим, как именно берут мазок на ПЦР у женщин. Процедура выполняется врачом-гинекологом, урологом, венерологом или акушеркой при помощи стерильного тампона.
Им проводят по местам забора материала, по кругу, без нажатия:
- мочеиспускательный канал
- цервикальный канал
- стенка влагалища
- ампула прямой кишки
- слизистая глаза и нижнее веко
- задняя стенка глотки и миндалины
Тампон помещается в стерильную пробирку или им проводится по предметному стеклу с фиксатором. После чего материал доставляется в лабораторию.
Соскоб проводится тем же стерильным тампоном. Только вращательными движениями и с приложением некоторого усилия или специальной «щеткой». Далее щетка или тампон также помещается в стерильную пробирку или ими проводится по предметному стеклу.
Забор мочи на ПЦР осуществляется стерильный контейнер, первые 50 мл, не выделяя средней порции. Далее контейнер закрывается и доставляется в лабораторию.
Забор мокроты на ПЦР проводится в стерильный контейнер. Предварительно пациенту предлагают выпить побольше жидкости.
С утра пациенту предлагают откашляться и отделить мокроту в стерильную посуду. Данное исследование используют для диагностики туберкулеза, хламидиоза и микоплазмоза.
Как берут кровь на ПЦР
Для сдачи крови в процедурную надо явиться натощак, накануне допустим только легкий ужин. При анализе методом ПЦР используется кровь из вены, для чего специальной иглой на вакутейнере производят прокол.
После присоединяют стерильную пробирку с пробкой к другому концу иглы. Под действием градиента давления (вакутейнер создает вакуум между иглой и пробиркой) кровь легко поступает в пробирку.
ПЦР крови на ВИЧ и гепатиты выполняется в реальном времени с определением концентрации ДНК (РНК) в плазме. Это исследование требуется для решения о назначении противовирусной терапии и прогноза степени риска передачи вируса от беременной к плоду.
Какой материал брать на исследование, решает врач исходя из клинической ситуации. Обычно мазки и моча используются для проведения ПЦР при определении возбудителей ЗППП.
Кровь на ПЦР забирается при постановке диагноза герпеса, цитомегаловируса, ВИЧ и гепатитов, а также токсоплазмоза.
Мазок на ПЦР из зева или, проще говоря, изо рта – при диагностике мононуклеоза и ЗППП: цитомегаловирус, ВПЧ, сифилис.
Мазок из ануса на ПЦР применяется при определении подавляющего большинства ЗППП.
Какие именно возбудители будут разыскиваться при помощи ПЦР – определяет врач- венеролог после осмотра.
Хранение и транспортировка ПЦР анализов
Стерильные емкости и предметные стекла категорически нельзя замораживать. Хранить в помещении не более двух часов, и только в крайних случаях – в холодильнике еще 20 часов. Необходимость обеспечивать температурный режим транспортировке в специальную генетическую лабораторию обуславливает использование термоконтейнеров. В них поддерживается температура от 4 до 8 градусов Цельсия.Поэтому очевидным плюсом медицинской организации является собственная лаборатория, способная выполнить полимеразную цепную реакцию.
Аналитический этап ПЦР диагностики
В лаборатории сперва выделяется ДНК из предоставленного образца.
Далее материал помещается в термостат в микроцентрифужных пробирках с добавлением амплификационной смеси на несколько часов. Для сравнения выполняется контроль с известными ДНК определенных микроорганизмов. Выполняется электрофорез со смесью бромистого этидия и ДНК, что вызывает свечение в ультрафиолетовых лучах.
Электрофорез позволяет разделить продукты амплификации. При положительном результате теста они дают оранжевое свечение в коротком участке светового спектра.
Интерпретация результатов ПЦР анализа
При определении наличия ДНК (РНК) полимеразная цепная реакция считается положительной, и это точно демонстрирует наличие возбудителя.
Для диагностики вируса иммунодефицита человека и гепатитов В и С используют ПЦР с определением концентрации ДНК (РНК).
Для ДНК высокой считается концентрация 1,0 x 105 копи на такие инфекции как герпес, цитомегаловирус, ВИЧ и гепатиты, а также токсоплазмоз.
Количественная оценка ПЦР или количественный анализ экспрессии генов говорит об их активности. В результате экспрессии генов образуются определенные белки. которые и считаются в рамках количественной ПЦР в реальном времени. По результату этого исследования врач судит об инфекционной нагрузке и активности возбудителей.
При диагностике ИППП используют несколько диагностических исследований. ПЦР позволяет довольно точно определить наличие определённого возбудителя уже в продромальный период развития инфекции.
Когда симптомы больше напоминают простуду, чем конкретное заболевание. Интересно также оценить напряженность иммунного ответа макроорганизма. Для этого назначаются серологические исследования ИФА, РПГА, РИФ и прочие.
Серология показывает, сколько антител и к какому именно антигену сформировалось, какая стадия заболевания наблюдается. Существует понятие «титр антител». То есть их количество, характеризующее напряженность, то есть выраженность иммунитета. Случается, что ответы разных исследований противоречат друг другу.
ПЦР является реакцией проверки, то есть именно по её положительному результату судят о наличии возбудителя. Например, если ПЦР положительна, а мазок на флору отрицательный.
Мы считаем, что в последнем случае в материал просто не попало нужного количества микроорганизмов. Или они не окрасились по разным причинам. Если ПЦР положительна, а серологические пробы отрицательны, то организм человека не вырабатывает иммунного ответа на возбудителя.
Наблюдается состояние иммуносупрессии, что бывает:
- при ВИЧ
- при приёме специальных лекарственных препаратов после трансплантации
- при лечении аутоиммунных заболеваний
- в период выздоровления после тяжёлой болезни
- при истощении или тяжелой хронической усталости
Если ПЦР отрицательна, а серологические пробы положительны, то нужно смотреть на фракцию иммуноглобулинов. IgM характерен для острой фазы течения заболевания при первичном заражении.
В такой ситуации врач может повторить забор материала. Или ориентироваться по точному, но длительно выполняемому культуральному методу (посев культуры возбудителя на питательные среды).
Высокий титр Ig A или IgG могут свидетельствовать о хронической инфекции в стадии обострения. А их низкие титры – просто о том, что пациент перенёс данное заболевание. Именно поэтому серологические пробы не используют для контроля эффективности лечения. В частности, проводить ПЦР нужно после определенного промежутка.
Цена анализа зависит от материала, использованного для ПЦР, и колеблется от 350 до 1200 рублей.
При необходимости сдать ПЦР анализы обращайтесь к автору этой статьи – венерологу в Москве с многолетним опытом работы.
ПЦР диагностика инфекций
Мазок ПЦР у женщин, что это такое, для чего берется и по каким правилам? Данное исследование позволяет очень точно выявить возбудителей различных инфекций и виновников воспалительных процессов (вульвовагинитов). Берется ПЦР анализ у живущих половой жизнью и никогда не обследовавшихся, планирующих беременность, имевших незащищенные половые контакты, мазок сдают и женщины, и мужчины.
Полимеразная цепная реакция, именно так расшифровывается ПЦР, дает возможность в небольшом количестве взятого на анализ материала найти генетическую информацию инфекционного возбудителя. Самым распространенным является мазок методом ПЦР на ИППП (хламидии, уреаплазмы, микоплазмы), кстати, эти же инфекции относятся к разряду «скрытых», не дающих явной симптоматики и не выявляющихся при обычных, рядовых исследованиях. Часто проводится диагностика герпетических инфекций, а также различных типов папилломавирусной инфекции. При этом особое внимание уделяется тем типам, которые вызывают рак шейки матки, то есть онкогенным.
Мазок ПЦР на хламидии и другие инфекции берут у будущих мам, если те во время планирования ребенка его не сдавали. Данное исследование обязательно необходимо, так как скрытые инфекции, передающиеся половым путем, могут много лет «сидеть» в организме, никак себя не проявляя, но очень навредят будущему ребенку, могут привести к выкидышу, преждевременным родам, внутриутробной инфекции, а вследствие этого гибели плода. Конечно, лучше проводить лечение на этапе планирования ребенка, но если ПЦР диагностика инфекций их обнаружила уже после зачатия — не беда, есть современные безопасные препараты, которые можно принимать будущим мамам.
Многие женщины боятся сдавать анализы, наслушавшись и начитавшись о том, что любые манипуляции «там» врача могут спровоцировать выкидыш. А тем более нельзя сдавать мазок ПЦР при беременности, так как материал берется из шейки матки, а не с ее поверхности. Но это не страшно. Длина шейки матки немаленькая. Инструмент не попадет в матку, никак не затронет ребенка. И шейку расширять для взятия биоматериала не нужно. Мазок из цервикального канала безопасен для матери и ребенка и безболезненен.
Делается данное исследование не только с целью обнаружения инфекций, передающихся половым путем, но и возбудителей бактериального вагиноза и кандидоза — гарднерелл и грибов рода Кандида. Так что, расшифровка мазка на ПЦР диагностику бывает полезна и в таких «банальных» случаях.
Мазок ПЦР
ПЦР диагностика инфекций
Мазок ПЦР у женщин, что это такое, для чего берется и по каким правилам? Данное исследование позволяет очень точно выявить возбудителей различных инфекций и виновников воспалительных процессов (вульвовагинитов). Берется ПЦР анализ у живущих половой жизнью и никогда не обследовавшихся, планирующих беременность, имевших незащищенные половые контакты, мазок сдают и женщины, и мужчины.
Полимеразная цепная реакция, именно так расшифровывается ПЦР, дает возможность в небольшом количестве взятого на анализ материала найти генетическую информацию инфекционного возбудителя. Самым распространенным является мазок методом ПЦР на ИППП (хламидии, уреаплазмы, микоплазмы), кстати, эти же инфекции относятся к разряду «скрытых», не дающих явной симптоматики и не выявляющихся при обычных, рядовых исследованиях. Часто проводится диагностика герпетических инфекций, а также различных типов папилломавирусной инфекции. При этом особое внимание уделяется тем типам, которые вызывают рак шейки матки, то есть онкогенным.
Мазок ПЦР на хламидии и другие инфекции берут у будущих мам, если те во время планирования ребенка его не сдавали. Данное исследование обязательно необходимо, так как скрытые инфекции, передающиеся половым путем, могут много лет «сидеть» в организме, никак себя не проявляя, но очень навредят будущему ребенку, могут привести к выкидышу, преждевременным родам, внутриутробной инфекции. а вследствие этого гибели плода. Конечно, лучше проводить лечение на этапе планирования ребенка, но если ПЦР диагностика инфекций их обнаружила уже после зачатия — не беда, есть современные безопасные препараты, которые можно принимать будущим мамам.
Многие женщины боятся сдавать анализы, наслушавшись и начитавшись о том, что любые манипуляции «там» врача могут спровоцировать выкидыш. А тем более нельзя сдавать мазок ПЦР при беременности, так как материал берется из шейки матки, а не с ее поверхности. Но это не страшно. Длина шейки матки немаленькая. Инструмент не попадет в матку, никак не затронет ребенка. И шейку расширять для взятия биоматериала не нужно. Мазок из цервикального канала безопасен для матери и ребенка и безболезненен.
Делается данное исследование не только с целью обнаружения инфекций, передающихся половым путем, но и возбудителей бактериального вагиноза и кандидоза — гарднерелл и грибов рода Кандида. Так что, расшифровка мазка на ПЦР диагностику бывает полезна и в таких «банальных» случаях.
МАЗОК НА ИНФЕКЦИИ
КАК СДАТЬ МАЗОК НА ИНФЕКЦИИ
Мазки на инфекции у женщин — один из самых распространенных методов диагностики в гинекологии. Этот анализ совершенно безопасен и безболезненен для женщины и весьма информативен для врача гинеколога. На основе мазка на инфекции могут проводиться два анализа: исследование микробной флоры и определение степени чистоты влагалища.
Существуют несколько методов лабораторного исследования материала мазка на инфекции. Обычно это три:
- бактериологический посев мазка на инфекции,
- ПЦР-диагностика мазка на инфекции и
- микроскопия мазка на инфекции (т.н. мазок на флору ).
Возможно взятие материала для диагностики из следующих мест:
- U — уретра,
- C — шейка матки,
- V — влагалище,
- R — прямая кишка,
- O — ротоглотка.
В данном материале мы рассмотрим последний метод лаборатороной диагностики, т.е. простой мазок на инфекции , который чаще всего берут на приеме у гинеколога для начальной диагностики.
Как подготовиться
- 1-2 суток перед визитом к врачу для сдачи анализов воздержаться от половых контактов;
- Перед сдачей мазка на половые инфекции рекомендуется не мочиться в течение 2 часов.
- Накануне анализа рекомендуется провести провокацию. Самым простым и наиболее надежным методом считается алиментарная провокация (алкоголь, соленое, острое).
- Если есть такая возможность, женщинам желательно сдавать мазок на ЗППП сразу после месячных, на 4-5 день цикла
Как берется мазок на инфекции
Взятие мазка на инфекции проводится в манипуляционном кабинете врачом гинекологом на гинекологическом кресле.
Во влагалище женщины врач-гинеколог вводит гинекологическое зеркало и осуществляет взятие материала (выделений) из всех предполагаемых очагов инфекции с помощью одноразового шпателя — зондика.
Обычно взятие мазка на инфекции осуществляется из трех точек — из наружного отверстия уретры, влагалища и шейки матки. Одноразовый шпатель представляет собой пластмассовую палочку с расширенным концом, которым, делая мазки, гинеколог равномерно распределяет взятый материал по специальному чистому предметному стеклу.
Взятие мазка на инфекции у девственницы
Взятие мазка на инфекции у девственницы осуществляется таким же образом как и у женщин, живущих половой жизнью. Основное отличие взятия мазка на инфекции в этом случае — гинекологическое зеркало не используется, взятие материала для мазка на инфекции из влагалища проводится через отверстие в девственной плеве. Возможно по показаниям взятие анализа мазка на инфекции из уретры или прямой кишки. Процедура взятия мазка на инфекции у девственницы в нашим врачом абсолютно безболезненна, повреждение девственной плевы исключено. Таким же образом берут мазок на инфекции и у самых маленьких пациенток .
Мазок на инфекции дает врачу гинекологу информацию прежде всего о наличии воспаления (по количеству лейкоцитов), приблизительном составе флоры влагалища, наличии молочницы, гарденерелеза, трихомониаза, гонореи.
Хороший результат мазка на инфекции (т.е. их необнаружение) нельзя считать абсолютно достоверным, особенно при наличии определенных жалоб. Объясняется это рядом объективных моментов, влияющих на результат мазка на инфекции. В ситуациях, когда признаки воспаления налицо, но причина его по результатам обычных мазков на инфекции не ясна, гинекологи могут прибегнуть к дополнительным методам исследования инфекции, например к ПЦР-диагностике по мазку, бакпосеву.
- Вирусные, хламидийные, микоплазменные и уреаплазменные инфекции практически не определяются в урогенитальном мазке на инфекции. Вирусы, хламидии, уреаплазмыи микоплазмы представляют собой микроорганизмы очень малых размеров, которые сложно заметить под микроскопом при обычном анализе мазка. Для диагностики этих инфекций существуют другие, более информативные методы (мазок ПЦР, ИФА-диагностика).
- Обнаруженный грибок в мазке на инфекции — верный симптом молочницы. Но кандидоз может быть сопутствующим заболеванием, развившемся на фоне более серьезной половой инфекции (ИППП).
- Повышенные лейкоциты при микроскопии мазка на инфекции могут быть следствием ошибочной диагностики, при случайном попадании в мазок при взятии гноя. Большое количество лейкоцитов мазка на инфекции помешает врачу-лаборанту увидеть возбудителя ЗППП.
- Во многих случаях влагалищный мазок на инфекции позволяет выявить инфекцию, но не природу (возбудителя) этой инфекции и что не менее важно — с помощью мазка не возможно выяснить чувствительность этих возбудителей к определенным антибиотикам. Эту проблему можно решить проведением бактериологического посева мазка на инфекции.
ДРУГИЕ ВИДЫ АНАЛИЗОВ
Анализ ПЦР
На сегодняшний день существует огромное количество инфекций, выявлять которые становится все сложнее из-за способности приспосабливаться и эволюционировать. Существуют традиционные морфологические, иммунологические и биохимические методы диагностики, а также методы с применением новейших технологий для получения высокоточных результатов.
Один из новейших методов молекулярной биологии — ПЦР-диагностика. ПЦР расшифровывается как полимеразная цепная реакция. По сравнению с другими методами у анализа ПЦР есть ряд преимуществ. С его помощью можно специфично увеличить (амплифицировать) в 100 раз участок ДНК возбудителя в образце для исследования. В теории этот анализ может обнаружить даже одну копию ДНК возбудителя в образце, что значит — предел чувствительности у него отсутствует.
Высокая чувствительность не единственное преимущество. Также метод ПЦР — абсллютно специфичен и выполненный правильно не может дать ложноположительный результат. То есть есть инфекции нет, то анализ никогда не покажет, что она есть. Поэтому сейчас очень часто для утверждения диагноза дополнительно сдают анализ ПЦР, чтобы определить возбудителя и его природу.
Как берут анализ ПЦР
Для того, чтобы получить верный результат очень важно правильно собрать материал. Также важна пробоподготовка.
Необходимо отметить, что анализ ПЦР может быть сделан с использованием различных биологических материалов, в которых содержатся микробы или же их фрагменты.
При выявлении половых инфекций у человека, в качестве материала для анализа собирают выделения из половых органов, мазки из шейки матки и из мочеиспускательного канала, моча.
Чтобы диагностировать гепатит С вирусный и ВИЧ инфекцию берут кровь. Сейчас для этого используют вакуумные системы, которые делают забор крови минимально травматичным и максимально изолированным от внешней среды.
Инфекционный мононуклеоз диагностируют при помощи мазка из зева.
Поэтому, перед сдачей анализа ПЦР уточните у врача, какие биоматериалы понадобятся для анализа.
Мы ответили на вопрос: анализ ПЦР что это? Теперь расшифруем результат анализа. Если он отрицательный, то в вашем биоматериале не было обнаружено инфекции, которую хотели выявить. Если результат положительный, то обнаружили следы инфекции. Это значит, что с большой точностью можно утверждать, какой инфекцией заражен человек.
ВНИМАНИЕ! Информация, опубликованная на этом сайте является справочной или популярной. Диагностика и назначение лекарственных препаратов требуют знания истории болезни и непосредственного обследования врачом. Мы рекомендуем Вам, для исключения случаев недопонимания, по вопросам применения лекарств и диагностики обращаться к лечащему врачу.